As mensagens são analisadas sempre que são sinalizadas pelo sistema automático. Dado o alerta, são lidas pelos moderadores. Se o conteúdo, de facto, viola a política do Facebook, o moderador tem então permissão para agir. «Impedimos que essas mensagens continuem», explicou Zuckerberg em entrevista à Vox.
Ao contrário do WhatsApp, a popular plataforma de troca de mensagens adquirida pelo Facebook em 2014 por aproximadamente 19,4 milhões de dólares, o Messenger não fornece encriptação automática de conversas. Os utilizadores devem ativar a funcionalidade Conversas Secretas para garantir tal. Só aí, apenas os participantes na conversa conseguem ler as mensagens trocadas.
Um porta-voz do Facebook Messenger frisou que estas ferramentas de monotorização são úteis sobretudo para detetar situações de abuso de imagens infantis ou se um link carregar malware ou vírus.
